Эркин Мухитдинов родился в 1976 году в Андижанской области. В 1997 году окончил Андижанский институт экономики (бакалавр), в 2000 году — Академию банковского дела и финансов (магистр), а в 2007 году — Высшую школу Института развивающихся экономик в Японии.

До назначения работал на различных должностях в Национальном банке внешнеэкономической деятельности, АКБ «Туронбак», Центральном банке, Кабинете Министров, Министерстве занятости и сокращения бедности и в хокимияте Ахангаранского района.

Эркин Мухитдинов – доктор философии в области экономики. Награжден орденом «Дустлик».