Секретариат министра

Центральный аппарат

Отдел развития и управления человеческими ресурсами

Организационно-контрольный и аналитический отдел

Отдел стратегического планирования и методологии

Управление юридических услуг и работы с обращениями

Пресс служба

Отдел противодействия коррупции и комплаенс-контроля

Управление внутреннего аудита

Отдел формирования перспективных проектов в водном хозяйстве

Управление по финансово-экономическим вопросов

Отдел мониторинга и планирования бюджетных средств бюджетной системы

Управление внедрения водосберегающих технологий

Управление трансграничного водопользования и водного кадастра

Отдел по вопросам международных отношений и Всемирной торговой организации

Отдел ведения кадастра гидротехнических сооружений

Управление развития государственно-частного партнерства и внедрения аутсорсинговых услуг

Отдел внедрения и развития цифровых технологий